使用遙控器操作，是MCE很重要的一個特色。跟Apple的遙控器相比，微軟MCE遙控器上的按鍵實在多得有點嚇人。

各家廠商所附的遙控設計不一定相同，但基本按鈕與配置都是相通的。在一隻標準的MCE遙控器上，大約會有40顆按鈕。跟某些整合型的電視遙控器相比，按鍵數量則是差不多。

造型不同，功能與按鍵配置都差不多的MCE遙控器

為了讓多種功能的操作比較直接而快速，MCE遙控器大致可分為四區：播放控制、選單移動、常用按鍵、數字鍵。

播放控制區塊

這個區塊主要用來控制多媒體檔案的播放，所以有播放、暫停、停止、快轉、倒退、上一首、下一首，還有直接錄影、錄音的紅球「錄製鈕」，圖示都是採通用的表示法。

選單移動區塊

這個區塊是用來代替滑鼠的作用，而且也是跟滑鼠操作相對應的。上下左右與OK的五向導航鍵，等同於用滑鼠在選項間移動，以及按左鍵確認項目。右上方的「i」鈕，等同滑鼠右鍵，可以在檔案或頁面中叫出相關功能表。左上角的「<-」就是「回上頁」，一般滑鼠上則沒有這個按鈕。

常用按鍵區塊

這一區有MCE的綠色按鍵，在XP底下用來開啟Media Center，進到Media Center後，則是用來快速跳回MCE主要功能的首頁。兩旁有增減音量、上下頻道的按鍵，是在看電視常用到的，還有另一顆是靜音鈕。再下方還有四顆快速按鍵：已錄節目、節目表、電視、DVD主選單。

數字按鍵區塊

最下面是數字鍵盤，通常還是用來選台比較多，需要輸入文字時也是在這邊操作。有些遙控器會在這邊標上注音，以對應中文輸入功能，因為在MCE中，並非所有輸入頁面都有對照圖可供參考。

有注音對照的輸入畫面